9月15日，第二轮自治区生态环境保护督察组在自治区自然资源厅党组成员、厅长助理惠小朝带领下到索县开展调研。那曲市自然资源局党组副书记、局长洛桑加措，索县县委书记高俊岭，县委副书记、县长巴多，副县长周增全、米次及相关部门负责人陪同调研。

督察组根据相关问题线索和历次中央、自治区生态环境保护督察调研暗访问题清单，对污水处理厂、入河排污口等问题点位整改情况进行了检查。督察组重点查看了索县污水处理厂的在线监测站房、污水总排口、格栅房、人工湿地等设施设备运行管理情况以及索县入河排污口整治情况。现场听取了县住建局、县城管局，那曲市生态环境局索县分局推进问题整改工作的汇报，对整改成效表示肯定，同时也提出了进一步整改意见。

按照督察组“边督边改”工作要求，索县县委、县政府高度重视，针对虫草大酒店对面新发现的建筑垃圾侵占河道问题，第一时间安排住建、城管、水利等部门整改，通过组织工程机械将索曲河边建筑垃圾转移至建筑垃圾填埋场，设置隔离防护围栏和河长制公示牌、警示标语等方式，于9月16日早上完成整改，并获得督察组肯定。